股份公司的股东在某些情况下不能查账，主要原因如下：
如果公司内部治理非常规范，股东对公司经营状况有充分的了解，那么通常不需要查账。查账主要是基于对公司治理的不信任，怀疑大股东、实际控制人或公司高管侵害了公司利益或股东利益。
股份公司的股东虽然拥有知情权，但具体到查阅会计账簿的权利，涉及公司的商业秘密。因此，法律限制了股东查阅会计账簿的权利，以防止商业秘密泄露。
如果股东查阅会计账簿的目的不正当，可能损害公司合法利益，公司可以拒绝提供查阅。例如，如果股东是公司的竞争对手，或者有可能利用查账资料进行不当竞争或损害公司利益，公司有权拒绝查账请求。
根据我国相关法律规定，股份公司的股东仅有权查阅和复制公司的财务会计报告，而没有查阅公司会计账簿的权利。股东要求查阅会计账簿需要先向公司提出书面请求，并说明目的。如果公司有合理根据认为股东查阅会计账簿有不正当目的，可以拒绝提供查阅，并需要书面答复股东并说明理由。
并非所有股东都有权查账。例如，隐名股东或代持股东在没有得到其他股东认可的情况下，可能无法行使知情权和查账权。此外，如果股东已经离开公司，就不再是股东身份，也就不能行使知情权。
综上所述，股份公司的股东不能查账的情况主要包括公司内部治理规范、商业秘密保护、不正当目的、法律限制以及股东身份与权限等方面。在实际操作中，股东应当遵循法律规定，通过正当途径行使知情权。